北京航天總醫院口腔科承擔東高地及周邊地區數十萬人的口腔醫療保健工作。每年有1000多0多受兒童窩溝封閉治療，這在豐臺區是獨一無二的。此外，醫院還全面開展了口腔內科、口腔外科、口腔修復、口腔正畸、口腔粘膜等專業門診；本科可滿足公眾對補牙、拔牙、鑲牙、矯正等醫療需求。